Illumina DNA測序儀故障維修
維修排除illumina DNA 測序儀問題:
自動 DNA 測序是分子生物學實驗室中最常見且通常最強大的技術之一。不幸的是,它并不總是有效,當它無效時,很難找出哪里出了問題。幸運的是,大多數失敗(或次優)的 DNA 測序結果只有有限的幾個原因。為了幫助排除illumina DNA 測序問題,我們創建了一系列指南來確定最常見的原因。這些指南還包括有關如何克服每種問題類型的提示,以及提高 DNA 測序質量的更一般提示。如果您對這些指南有任何意見或問題,請電話聯系我們的支持團隊,我們很樂意聽取您的建議。
我的illumina DNA測序儀測序數據中的信號強度很低。什么可能導致這種情況?
低信號強度可能由許多因素引起,包括熱循環儀故障(在整個板故障的情況下)、清理不良和測序模板數量/質量不足。使用測序試劑盒中提供的 pGEM 對照和 -21 M13 引物來隔離模板質量/質量問題或測序反應失敗。如果 DNA 質量、PCR 純化和測序反應純化步驟正確執行,在測序反應中增加模板和引物可以改善信號。有關測序反應中使用的模板 DNA 量,請查看此信息。 檢查模板的質量。如果需要,準備新鮮的 DNA 并重復反應。您可以訪問我們的質粒 DNA 純化支持中心頁面以獲取有關純化的提示。
一般來說,我們建議您:
1、確保在illumina測序工作流程中使用新鮮、未過期的試劑。
2、檢查熱循環儀,將升溫速率設置為 1 攝氏度/秒,使用正確的熱循環參數并檢查熱循環儀校準。
3、準備新的底漆工作庫存或訂購新底漆。在最終反應中使用 3.2 pmol。
4、如果在illumina測序反應中使用的 BigDye™ Terminator Ready Reaction Mix 少于推薦量,請在 20 µL 最終反應體積中使用 8 µL 的推薦量,或在 10 µL 最終反應體積中使用 4 µL。
5、如果存在染料斑點,請查看毛細管電泳 DNA 測序指南或與凈化套件制造商聯系,以獲取更多故障排除建議以去除染料斑點。
如何確定illumina DNA 測序失敗的原因
確定illumina DNA 測序結果不佳的原因通常非常困難,因為特定的測序問題可能有許多不同的原因,或者是多種相互作用因素的結果。通常,找出特定問題真正原因的唯一方法是執行消除過程。通過目視檢查測序軌跡的原始數據色譜圖和處理后的數據色譜圖,可以大大簡化此過程。在以下指南中,我們提供了有關最常見的測序問題的詳細信息,以及對其最可能原因的建議。原因按從最常見到最不常見的順序列出。我們還提供了有關如何克服每種測序問題類型的解決方案(如果已知)。手動檢查的替代方法(如果您運行的跟蹤次數過多,這將變得非常勞動密集型)是使用自動跟蹤分析系統,例如我們的QualTrace III DNA 測序 QC 軟件。QualTrace III將針對許多不同的測序問題自動掃描跡線,并且由于它通過分析原始數據來工作,因此它可以與任何堿基識別器一起使用。